安徽中醫藥大學創建於1959年，其前身為1952年創立的安徽省中醫進修班。1959年，安徽省政府正式批準成立安徽中醫學院。1970年，安徽中醫學院並入安徽醫學院。1975年，國家教育部批準恢複安徽中醫學院。2000年，安徽省醫藥學校並入安徽中醫學院。2011年，省政府批準在安徽中醫學院的基礎上組建成立安徽省中醫藥科學院。2013年，教育部同意安徽中醫學院更名為安徽中醫藥大學。目前，學校已發展成一所以中醫藥學科為主，相關學科協調發展，辦學層次齊全，中醫藥特色鮮明的高等中醫藥院校。麵向未來，學校將繼續堅持“質量立校、人才興校、科技強校、文化塑校、依法治校、開放榮校”六大戰略，著力培育“精誠是新”中醫藥人才，構築安徽中醫藥協同創新高地，引領安徽中醫藥事業產業發展，建成國內有實力、省內高水平、行業有影響的中醫藥特色鮮明的地方高水平大學，為建設現代化五大發展美好安徽、服務人民大眾健康做出更大貢獻。
