學校肇始於1950年成立的長春市立中醫進修學校，前身是1958年成立的長春中醫學院，2006年更名為長春中醫藥大學。學校是吉林省省屬重點大學、國家中西部高校基礎能力建設工程高校、吉林省人民政府和國家中醫藥管理局共建高校、吉林省特色高水平大學建設高校。學校始終恪守“啟古納今，厚德精術”的校訓精神，牢牢抓住立德樹人這一根本任務，形成了從本科教育到碩士、博士研究生教育，以及高職教育、繼續教育、留學生教育等多層次、多類型的人才培養格局，為國家培養了各級各類人才5萬餘名，校友遍及海內外。學校突出中醫藥特色和優勢，產學研結合，不斷提高對區域經濟和社會發展的貢獻率。
