中國中醫科學院中藥研究所始建於1955年，是我國成立最早的一所國家級研究中藥的專門機構。自1983年起被確認為世界衛生組織傳統醫學合作中心。中藥研究所經過六十五年的科學研究實踐，培養造就了一批從事文獻、中藥資源及品種鑒定、化學、質量標準、炮製、製劑、藥理、毒理和新藥研發的科技骨幹。全所現有職工500餘人，設有中藥理論與本草文獻研究中心、生藥研究中心、中藥質量標準研究中心、中藥製劑研究中心、中藥炮製研究中心、中藥藥代動力學研究中心、中藥藥理研究中心、生物力藥理學研究中心、中藥安全評價中心（GLP）、 中藥注射劑安全性研究中心、中藥新藥研發中心、中藥生物技術研究中心、中藥數據中心、整合中藥學研究中心、霧化吸入製劑研究中心和期刊部，以及掛靠管理單位中國中醫科學院中藥資源中心、中國中醫科學院青蒿素研究中心。
