中國科學院南京地質古生物研究所成立於1951年,其前身為前中央研究院地質研究所及前中央地質調查所等機構的古生物室(組),目前是我國唯一的從事古生物學(古無脊椎動物學與古植物學)和地層學研究的專業機構。著名地質古生物學家、中國科學院副院長李四光教授為首任所長,此後斯行健院士、趙金科院士、吳望始研究員、曹瑞驥研究員、穆西南研究員、沙金庚研究員、楊群研究員先後任所長,現任所長詹仁斌研究員。本所目標是建成並保持一個國際一流的動、植物化石門類齊全的古生物學和地層學研究中心、谘詢服務中心、技術支撐中心、標本收藏中心、信息數據中心、人才培養基地和科學傳播基地。