新疆維吾爾自治區紅十字會是中國紅十字會的地方分會,是從事人道主義工作的社會救助團體。1987年成立後,掛靠自治區衛生廳,1998年依法理順管理體製,2004年成立黨組,直屬自治區人民政府領導聯係的廳級機構。業務工作接受中國紅十字會總會的指導。自治區紅十字會內設辦公室、事業發展部、賑濟救護部、籌資財務部、機關黨委(人事部)5個部室,下轄自治區紅十字會備災救災中心(艾滋病預防與關懷中心)、中國造血幹細胞捐獻者資料庫
新疆分庫、自治區紅十字會人體器官捐獻管理中心3個事業單位。目前全疆14個地州市成立紅十字會,理順率100%,全區96個縣市區全部成立紅十字會,實現了機構獨立設置,理順率100%;13個地州市成立黨組,建立基層紅十字組織2661個;團體會員單位3329個,會員39.6萬人(成人會員18.5萬人,青少年21.1萬人),誌願者1.72萬人。